De lengte van de fluithaas is 15 tot 25 cm lang. Ze hebben grote, donkerbruine ogen. Ze hebben kleine snorharen. Hun oren zijn rond en kort. Ze hebben scherpe klauwtjes, en geen staart. Verder zijn ze erg zacht en meestal bruin of grijs gekleurd.
De fluithaas is warmbloedig, want het is een zoogdier. Omdat de fluithaas warmbloedig is, heeft dit dier geen winterslaap nodig. De fluithaas heeft een constante lichaamstemperatuur.
De fluithaas heeft verbranding in het lichaam nodig, anders gaan zijn cellen dood, en zo ook het beest zelf. Voor verbranding is een brandstof nodig. Bij de fluithaas is die brandstof voor het grootste deel glucose. Dit haalt hij uit planten, want het is een herbivoor, een planteneter. Glucose komt in planten terecht door fotosynthese.